FORTRANの人がGPGPUを使って性能を出すために必要なこと

FORTRANからCUDAを呼ぶ２にあるやり方で、あと残り二つになりました。

• CUDAで（FORTRANに比べて）性能が出せそうな（且つ、FORTRANでボトルネックとなっているならなお良い）部分をCUDA化し、GPGPUで計算させる
• CPUとGPGPUの間での通信量を出来る限り少なくする

CPUとGPGPUの間での通信時間を少なくする：ソフト面から

CPUとGPGPUの間での通信時間を少なくする：ハード面から

host(CPU)-device(GPGPU)データコピーはPCI Expess経由となるので遅く、ボトルネックとなる。次世代のPCI-Express3.0は、SandyBridgeは対応になるみたいですが、早くても来年以降のようです。
自分のポリシーとして、ハードにしろ、ソフトにしろ、整備されるのを待っているのは得策ではないと思っています。ソフト面でどれだけカバーできるか、隠蔽できるかに性能を出せるかがかかっていると思います。