GPGPUをPCにセットアップする際に注意すること

ハード的な注意点として、

• グラボの大きさ（PCケースに入りきるか）
• 電源容量

の2つがあります。GTX260はグラボの中でも特に大きいので要注意です。自分は、手持ちのHAF932、電源はKEIANの1000Wを使いましたので十分余裕がありました。
また、自分はディスプレイ出力と計算用途で2枚グラボを用意しました。

計算用: GTX260
ディスプレイ出力: GeForce8400

両方ともnvidiaのチップ製品なので、競合することはありませんでした。ドライバのインストールは通常（？）のGPUと変わりありません。
どちらGPUをディスプレイ出力用とするかの設定ですが、これはBIOSに依存すると思います。ASUS P6T SEでは、PCIに番号がふられていて、1番、2番、3番の順番に優先されるようです。P6T SEでは変更できないようですが、M/BによってはBIOS設定にてPCIスロットの優先順位を変更することが出来るみたいです。
また、どちらのGPUを計算用に使うかですが、それはCUDAをセットアップすると、自動的に高性能のGPUが優先して使われるようです（自分で選択することも可能）。